Embora os dois tenham compartilhado um capítulo significativo de suas vidas juntos, eles nunca se casaram, mesmo que Anthony tenha se casado várias vezes posteriormente.
No início da década de 1990, antes de Marc Anthony alcançar fama internacional, Debbie Rosado era sua companheira. Juntos, construíram uma família e tiveram dois filhos — um menino e uma menina —, ambos que optaram por viver longe dos holofotes. O relacionamento chegou ao fim em 1995, após cerca de dois anos juntos, durante um período em que a carreira musical de Anthony estava em ascensão meteórica, impulsionada pelo enorme sucesso do álbum Todo a su Tiempo .

Embora inicialmente tenham administrado a criação compartilhada dos filhos de forma amigável, posteriormente surgiram tensões em relação às responsabilidades financeiras e ao envolvimento parental. Isso culminou em uma disputa judicial no Queens, Nova York, em maio de 2000, referente à pensão alimentícia. Na época, Anthony pagava a pensão semanalmente, arcava com o aluguel de Rosado e com outras despesas. O caso ganhou notoriedade após a revelação de que o cantor havia comprado uma mansão multimilionária em Manhattan, além de possuir outros imóveis em outros locais. O tribunal acabou exigindo que ele incluísse o filho no plano de saúde oferecido pela empresa de Rosado.

Apesar das diferenças, Debbie reconheceu publicamente que Marc Anthony é um bom pai, embora suas abordagens parentais sejam diferentes. Desde então, ela mantém uma vida muito privada, e pouco se sabe sobre seus relacionamentos pessoais atualmente.

Sua primeira filha, Ariana Muñiz, nasceu na década de 1990. Apesar de vir de uma família famosa, Ariana manteve sua vida bastante privada, com exceção de uma breve participação como atriz na série de TV South Beach , em 2006. Mais tarde, Debbie e Marc adotaram um filho, inicialmente chamado Alex, agora conhecido como Chase. Aos 27 anos, Chase também mantém um perfil discreto, mas é conhecido por ter um forte laço com o pai e por ter aceitado as novas parceiras de Marc Anthony.

Desde então, Marc Anthony casou-se várias vezes, mais recentemente com a modelo paraguaia Nadia Ferreira, que é mais de três décadas mais jovem que ele — uma diferença de idade que chamou a atenção do público, especialmente considerando que ela é mais nova que alguns de seus filhos.